Το έργο στοχεύει να βελτιώσει την κατάσταση διατήρησης απειλούμενων φυτικών ειδών της Μεσογείου μέσω της υλοποίησης επειγόντων δράσεων και να διευρύνει τη σχετική επιστημονική γνώση. Τα μέτρα διαχείρισης επικεντρώνονται σε δράσεις εντός του φυσικού περιβάλλοντος, οι οποίες σε πολλές περιπτώσεις είναι απαραίτητο να υποστηριχτούν με δράσεις εκτός του φυσικού περιβάλλοντος.
Το CARE-MEDIFLORA, ως καινοτόμο και διεπιστημονικό έργο, θα ενδυναμώσει το δίκτυο των κέντρων διατήρησης, ερευνητικών ινστιτούτων και σχετικών φορέων των νησιών της Μεσογείου, στρατηγικών εταίρων για τη βιωσιμότητα των μέτρων διαχείρισης.
Μέτρα διαχείρισης εντός του φυσικού περιβάλλοντος όπως οι μετεγκαταστάσεις πληθυσμών για λόγους διατήρησης είναι ιδιαίτερα σημαντικά στο πλαίσιο της κλιματικής αλλαγής, ιδιαίτερα για φυτικά είδη τα οποία δεν μπορούν να μεταναστεύσουν σε περιοχές καταλληλότερες από κλιματικής άποψης. Ιδιαίτερη προσοχή δίδεται σε φυτά των υγροβιότοπων καθώς είναι ευπαθή ακόμα και σε μικρές αλλαγές της βροχόπτωσης και της θερμοκρασίας και άρα χρήζουν επειγόντων δράσεων για την αντιμετώπιση των επιπτώσεων της κλιματικής αλλαγής.